המסה המולקולרית היחסית של קולגן גדולה. ישנן 3 רצועות שחייה בתמונת האלקטרופורזה. 2 רצועות השחייה המופיעות ליד 100kD הן שרשרת 1 ושרשרת 2 של מולקולת הקולגן, בהתאמה. רצועת השחייה אחת המופיעה ליד 200kD היא השרשרת של מולקולת הקולגן. כלומר, המסה המולקולרית היחסית של כל שרשרת פוליפפטידים של קולגן יכולה להגיע ל-100kD, והמסה המולקולרית היחסית של מולקולת קולגן אחת היא 300kD. שיטות הקביעה של משקל מולקולרי פוליפפטיד משמשות בדרך כלל SDS-PAGE, כרומטוגרפיה ג'ל וספקטרומטריית מסה. יש אנשים שמשתמשים בכרומטוגרפיה של סינון ג'ל כדי לקבוע את התפלגות המשקל המולקולרי של הידרוליזט קולגן בשאריות עור שעברו הכרום בערך 16.1kD. התפלגות המשקל המולקולרית של אוליגופפטידים של קולגן עור פלנדר נקבעת על ידי ספקטרומטריית מסה של זמן טיסה מרוכזת בעיקר ב-0.6-1.8kD. המשקל המולקולרי של פוליפפטיד הקולגן שעבר הידרוליזה על ידי פרוטאז מהחי הוא 2-7kD, שהוא רחב יותר מזה של פוליפפטיד הקולגן שעבר הידרוליזה על ידי פרוטאז צמחי.
