השפתון הראשון בעולם התגלה לפני כחמשת אלפים שנה בעיר השומרית אור. המצרים הקדמונים השתמשו בשפתונים שחורים, כתומים ומגנטה; ברומא העתיקה, שפתון בשם Fucus היה עשוי מצבע צמחי אדום סגול המכיל כספית ומשקעי יין אדום.
בסין העתיקה, זה נקרא שפתון, שחלקו יוצרו לצורות גליליות וחלקם אבקתי. שפתון אבקתי הוא פיגמנט שנמרח על שני צידי הנייר, והצבע נדבק לשפתיים באופן טבעי לאחר צביטה. בתקופת שושלת טאנג בסין, נשים אצולה וגיישות מהכנסייה אהבו להשתמש בצבע אלגום (אדום אוכר) להזרקת שפתיים, מה שנמשך בדורות מאוחרים יותר.
בתקופת המלכה ויקטוריה, השפתון נחשב לכלי לזונות והשימוש בשפתון היה טאבו.
גרלן מצרפת הציגה שפתונים בצורת צינור לארצות הברית, בעיקר מכר אותם לכמה אריסטוקרטים. שפתון צינור המתכת הראשון יוצר על ידי מוריס לוי וחברת ייצור Scoville בווטרברי, קונטיקט בשנת 1915, והיה מוצר פופולרי.
בשנת 1912, במהלך מחאה של סופרג'יסטיות לנשים בעיר ניו יורק, פמיניסטיות ידועות לבשו שפתון כסמל לשחרור האישה.
בשנות ה-20 בארצות הברית, הפופולריות של הסרטים הובילה גם לפופולריות של השפתון. לאחר מכן, הפופולריות של צבעי השפתון השונים הושפעה מכוכבי קולנוע וטלוויזיה, מה שהוביל לטרנד. אבל באותה תקופה, השפתון היה מבוסס על סבון, מה שהופך אותו לא נוח לשימוש.
בשנות הארבעים, נשים אמריקאיות הושפעו ממלחמה והשתמשו באיפור כדי לשמור על המראה הטוב שלהן. אחת מיצרניות השפתונים הגדולות באותה תקופה, Tangee, השיקה פעם פרסומת בשם "מלחמה, נשים ושפתון".
לאחר שהמלחמה הסתיימה בשנת 1950, כוכבות נשיות הובילו את הטרנד של לגרום לצורות שפתיים להיראות מלאות ומפתות.
בשנות ה-60, בשל הפופולריות של איפור פה בצבע בהיר כמו לבן וכסף, נעשה שימוש בקשקשי דגים ליצירת אפקט נוצץ.
בשנת 1970, שפתון סגול היה פופולרי בדיסקו. בסוף שנות ה-90, חומרים כמו ויטמינים, עשבי תיבול ותבלינים נוספו בהרחבה לשפתון.
לאחר שנת 2000, המגמה עברה להצגת יופי טבעי, עם צבעים טבעיים ומבריק.